澎湖海洋保育志工隊指,他們在鋤頭嶼西南海域水深約18公尺處,發現一座疑似人工推砌而成的城牆,證實潛水業者葉生弘2002年的說法。當年,葉生弘稱在鋤頭嶼西北方,水深大約12至32公尺處,有一座高1公尺、寬50公分且東西走向大約100公尺,疑似為人造建築的「東吉古沉城」。
葉生弘說,東吉古沉城的城牆上有負責擋風的卵石,至於城牆內則是有村屋、地基和牆壁等遺址。不過,東吉古沉城到底是海底文明,還是消失的古文明甚至是自然景觀,有待考古學家進一步查證。
目前,東吉古沉城已被列入保護區範圍。
澎湖的「虎井沉城」也是水下考古學者熱議的焦點。
民國71年潛水界名人謝新曦與蘇淵,率領2組潛水隊至澎湖海域探險並於海底發現大約3公尺高、南北向的石牆。85年,謝新曦再次下海不僅發現新的東西向石牆與南北向石牆成直角,還於北端發現一個直徑20公尺的圓形構造物。
對此,有人認為虎井沉城是玄武岩地形創造出來的自然構造,也有人認為這是人造建築。但台大教授黃士強別有一番看法,他認為虎井沉城很有可能是冰河時期的陸上建築物。